15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3285 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3285  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  238  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134933  hitchhiker  0.0000129314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3165  hypothetical protein  67.54 
 
 		 114 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2645  hypothetical protein  61.68 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.909866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2712  hypothetical protein  62.62 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2639  hypothetical protein  60.53 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0373938  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2819  hypothetical protein  63.55 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2889  hypothetical protein  60 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1550  hypothetical protein  51.75 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1135  hypothetical protein  49.12 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  0.48515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3216  hypothetical protein  43.86 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4299  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  33.75 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  26.37 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  29.2 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  32.94 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>