15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1135 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  0.48515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3165  hypothetical protein  55.26 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2819  hypothetical protein  53.1 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2645  hypothetical protein  57.89 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.909866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2712  hypothetical protein  56.84 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2889  hypothetical protein  60.42 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2639  hypothetical protein  59.18 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0373938  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3285  hypothetical protein  49.12 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134933  hitchhiker  0.0000129314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3216  hypothetical protein  48.18 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73955  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1550  hypothetical protein  50.91 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4299  hypothetical protein  42.53 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  35.35 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  29.13 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  20.19 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>