13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3165 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3165  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3285  hypothetical protein  67.54 
 
 		 114 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134933  hitchhiker  0.0000129314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2639  hypothetical protein  71.93 
 
 		 114 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0373938  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1550  hypothetical protein  59.65 
 
 		 114 aa  150  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2889  hypothetical protein  69 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2645  hypothetical protein  61.11 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.909866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2712  hypothetical protein  60.19 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2819  hypothetical protein  60.19 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3216  hypothetical protein  53.51 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1135  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  0.48515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4299  hypothetical protein  44.83 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  36.9 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>