14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4299 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4299  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  227  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2639  hypothetical protein  51.76 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0373938  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3165  hypothetical protein  43.56 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1550  hypothetical protein  45.54 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2645  hypothetical protein  43.27 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.909866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3285  hypothetical protein  44.68 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134933  hitchhiker  0.0000129314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2819  hypothetical protein  42.31 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2712  hypothetical protein  42.31 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2889  hypothetical protein  46.07 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1135  hypothetical protein  42.55 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  0.48515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  35.48 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3216  hypothetical protein  35.64 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  32.5 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0963  hypothetical protein  28.16 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>