25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0901 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  99.27 
 
 
137 aa  276  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  95.65 
 
 
138 aa  265  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  90.51 
 
 
137 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  90.51 
 
 
137 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  88.41 
 
 
138 aa  251  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  89.05 
 
 
137 aa  248  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  70.54 
 
 
128 aa  188  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  77.12 
 
 
135 aa  186  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  74.42 
 
 
128 aa  174  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  64.06 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  60.16 
 
 
128 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  61.19 
 
 
131 aa  153  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  58.59 
 
 
128 aa  147  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  43.31 
 
 
130 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  46.36 
 
 
131 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  40.46 
 
 
132 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  41.22 
 
 
132 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  43.9 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  43.2 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  37.84 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  30.34 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  26.88 
 
 
104 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>