25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2921 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  255  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  77.17 
 
 
128 aa  204  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  74.42 
 
 
137 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  74.42 
 
 
137 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  74.42 
 
 
137 aa  190  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  72.31 
 
 
138 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  72.31 
 
 
138 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  72.09 
 
 
137 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  72.09 
 
 
137 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  72.09 
 
 
137 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  71.32 
 
 
137 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  67.19 
 
 
130 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  71.43 
 
 
135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  62.7 
 
 
128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  64.06 
 
 
131 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  65.08 
 
 
128 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  42.42 
 
 
131 aa  104  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  39.23 
 
 
131 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  39.23 
 
 
131 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  42.98 
 
 
130 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  43.09 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  39.84 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  31.9 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  28.74 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  32.94 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>