25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0985 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  86.96 
 
 
138 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  88.41 
 
 
137 aa  251  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  88.41 
 
 
137 aa  251  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  87.68 
 
 
137 aa  248  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  84.78 
 
 
137 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  84.78 
 
 
137 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  84.06 
 
 
137 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  83.33 
 
 
137 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  67.18 
 
 
128 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  72.99 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  72.31 
 
 
128 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  59.09 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  59.09 
 
 
128 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  56.49 
 
 
128 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  54.96 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  47.75 
 
 
131 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  42.19 
 
 
130 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  39.69 
 
 
132 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  46.49 
 
 
131 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  39.69 
 
 
132 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  45.61 
 
 
131 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  27.96 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>