23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1921 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  96.18 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  85.5 
 
 		 131 aa  235  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  69.7 
 
 		 132 aa  191  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  69.47 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  67.42 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  44.62 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  41.54 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  39.69 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  45.61 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  45 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  43.2 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  43.2 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  43.2 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  42.34 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  43.86 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  42.98 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  42.98 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  42.98 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  42.11 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  42.15 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>