23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01748 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  74.05 
 
 
131 aa  200  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  74.24 
 
 
132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  74.24 
 
 
132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  70.99 
 
 
131 aa  193  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  69.47 
 
 
131 aa  189  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  49.21 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  40.77 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  43.31 
 
 
137 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  43.31 
 
 
137 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  42.19 
 
 
138 aa  103  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  43.75 
 
 
138 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  43.31 
 
 
137 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  43.31 
 
 
137 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  43.31 
 
 
137 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  40.91 
 
 
128 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  42.52 
 
 
137 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  43.12 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  37.88 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  41.82 
 
 
135 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  43.64 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  31.63 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>