24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1010 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  76.38 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  62.02 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  68.7 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  60.94 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  61.72 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  60.16 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  60.16 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  58.59 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  58.59 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  58.14 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  59.38 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  56.49 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  57.81 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  66.36 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  65.08 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  43.18 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  41.13 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  42.19 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  39.23 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  39.23 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  41.86 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>