24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2823 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  77.21 
 
 		 137 aa  209  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  76.47 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  76.47 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  75.74 
 
 		 137 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  73.53 
 
 		 137 aa  199  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  73.53 
 
 		 137 aa  199  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  72.99 
 
 		 138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  72.79 
 
 		 137 aa  196  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  70.8 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  69.53 
 
 		 128 aa  191  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  71.54 
 
 		 130 aa  187  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  71.43 
 
 		 128 aa  173  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  65.65 
 
 		 131 aa  169  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  64.34 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  39.23 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  37.69 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  41.67 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  36.64 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  35.88 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  36.23 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  30.34 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>