115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1528 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  100 
 
 
236 aa  480  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2319  nicotinamide mononucleotide transporter  60.87 
 
 
226 aa  274  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.73 
 
 
220 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  57.63 
 
 
221 aa  255  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  60.45 
 
 
221 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  60 
 
 
221 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  60 
 
 
221 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  61.86 
 
 
215 aa  241  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  56.94 
 
 
213 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  61.82 
 
 
217 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  61.82 
 
 
217 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  61.36 
 
 
217 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  61.36 
 
 
217 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.72 
 
 
212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  57.49 
 
 
215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  63.11 
 
 
233 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  47.96 
 
 
200 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  49 
 
 
217 aa  178  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  42.79 
 
 
208 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  40.2 
 
 
197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  43 
 
 
215 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02803  transporter, putative  35.81 
 
 
214 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.860055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.49 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.35 
 
 
197 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  31.98 
 
 
187 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  30.96 
 
 
191 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.35 
 
 
189 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  30.05 
 
 
187 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.16 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  27.92 
 
 
188 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  29.26 
 
 
187 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.92 
 
 
188 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.31 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  27.8 
 
 
210 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  28.93 
 
 
191 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.86 
 
 
188 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  29.17 
 
 
191 aa  88.6  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  27.66 
 
 
187 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.89 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  27.03 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.12 
 
 
220 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.83 
 
 
209 aa  85.5  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.45 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  28.88 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  27.72 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.72 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.72 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.37 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.9 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.96 
 
 
203 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.96 
 
 
203 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.34 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.62 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.15 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  26.63 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  26.63 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.88 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.75 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.06 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  22.96 
 
 
189 aa  72  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  27.47 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.21 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  22.06 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01590  nicotinamide mononucleotide transporter  22.79 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.702697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.04 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  24.04 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.04 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.03 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  25.13 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  25.13 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  25.13 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  25.13 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  25.14 
 
 
216 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.86 
 
 
188 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.46 
 
 
189 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  25.42 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  25.13 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.95 
 
 
207 aa  62  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.15 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.66 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.16 
 
 
216 aa  58.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3134  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2834  Nicotinamide mononucleotide transporter-like protein  21.21 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0225  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.38 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  21.74 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1096  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.81 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000531611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  19.82 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  19.82 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  19.82 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  32 
 
 
245 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.52 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2777  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  38 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1373  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  19.81 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341199  normal  0.244006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.54 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1079  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.2 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16090  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.32 
 
 
235 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1668  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.93 
 
 
239 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.33 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000335  ribosyl nicotinamide transporter PnuC-like protein  22.83 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.258606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.17 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>