118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2777 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2777  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  100 
 
 
234 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1096  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  52.86 
 
 
230 aa  275  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000531611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3134  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40.09 
 
 
230 aa  184  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0338  nicotinamide mononucleotide transporter  28.77 
 
 
219 aa  105  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.496829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.26 
 
 
204 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0901  nicotinamide mononucleotide transporter  25.82 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.93 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.93 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1518  nicotinamide mononucleotide transporter  26.07 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.93 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.29 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  27.81 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.49 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.5 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.82 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  26.82 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.82 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.8 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.87 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.87 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  26.67 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.87 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.04 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  32.72 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.4 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0884  hypothetical protein  29.19 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200323  normal  0.769102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  32.12 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.12 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.12 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0852  NMN family, nucleoside/purine/pyrimidine transporter  29.19 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0821  PnuC protein  28.57 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0775  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.79 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000228392  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00704  predicted nicotinamide mononucleotide transporter  25.79 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00368961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.79 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.1 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.79 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0916  protein PnuC  28.57 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.74639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0793  protein PnuC  28.57 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000546447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00693  hypothetical protein  25.79 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000335  ribosyl nicotinamide transporter PnuC-like protein  28.5 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.258606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.79 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0779  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.3 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0854  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.79 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.7 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0673  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.16 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000252701  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  28.04 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  29.93 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  28.07 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  27.6 
 
 
188 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  30.28 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0387  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.23 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0605919  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.33 
 
 
188 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.14 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.49 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  28.32 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.48 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  27.49 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  27.49 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  27.49 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  27.49 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.48 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  29.73 
 
 
187 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.73 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.85 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  23.79 
 
 
252 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  26.8 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.83 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  24.26 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0952  nicotinamide mononucleotide transporter  25.13 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  26.56 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.19 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.57 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  23.67 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  26.9 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  25 
 
 
187 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.66 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.56 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.99 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  27.27 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1785  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.34 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.75 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.97 
 
 
200 aa  58.5  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.1 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  27.46 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.9 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.12 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1654  nicotinamide mononucleotide transporter  22.22 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000129035  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.41 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  27.15 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.38 
 
 
207 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.66 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  32.08 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  32.08 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.94 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.4 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1395  nicotinamide mononucleotide transporter  23.08 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.140197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  27.56 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  26.32 
 
 
221 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  21.11 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.93 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
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