126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3448 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



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Plasmid clonability

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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  100 
 
 
208 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  59.9 
 
 
219 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  38.14 
 
 
222 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40.66 
 
 
189 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.85 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  39.34 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.5 
 
 
220 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  35.91 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.39 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  37.64 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  35.87 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  40.22 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.3 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  35.68 
 
 
187 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.2 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  32.58 
 
 
202 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.17 
 
 
209 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.68 
 
 
244 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.68 
 
 
244 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.68 
 
 
244 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  37.64 
 
 
187 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  32.97 
 
 
205 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  32.97 
 
 
205 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40.38 
 
 
189 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  34.9 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.29 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  34.57 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  37.91 
 
 
220 aa  98.6  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.04 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.4 
 
 
228 aa  95.9  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  33.85 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.85 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.85 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  28.26 
 
 
210 aa  94  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  34.95 
 
 
189 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.51 
 
 
203 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.51 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  31.28 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.26 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  32.49 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.68 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.96 
 
 
192 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.21 
 
 
199 aa  91.3  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.32 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.88 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.58 
 
 
224 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1373  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.85 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341199  normal  0.244006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.37 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.9 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.42 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.26 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.57 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.91 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1330  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.29 
 
 
232 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2319  nicotinamide mononucleotide transporter  25.6 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1079  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.22 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.22 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  27.22 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.67 
 
 
221 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  24.77 
 
 
244 aa  82  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  26.34 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  26.34 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  26.34 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  26.34 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  26.34 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2834  Nicotinamide mononucleotide transporter-like protein  33.17 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.33 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.88 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.51 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  26.34 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  25.82 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  23.73 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.27 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1668  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.96 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10840  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.41 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00558834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.14 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.11 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1969  putative integral membrane protein  27.78 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.86 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.86 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.86 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.77 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.28 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.2 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  26.57 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25 
 
 
241 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  25 
 
 
241 aa  72  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25 
 
 
241 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  26.57 
 
 
243 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.04 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.62 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01590  nicotinamide mononucleotide transporter  27.27 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.702697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  21.92 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0673  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.03 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000252701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16090  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.02 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.57 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  26.51 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.03 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
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