127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3696 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  37.25 
 
 
204 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.5 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  41.36 
 
 
191 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40.88 
 
 
228 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40.51 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  39.57 
 
 
191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  38.71 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  40.44 
 
 
187 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.17 
 
 
209 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.2 
 
 
212 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36 
 
 
203 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.82 
 
 
203 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  37.63 
 
 
210 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  36.92 
 
 
214 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.92 
 
 
214 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.84 
 
 
203 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.92 
 
 
214 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  39.58 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  36.61 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  35.91 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.36 
 
 
188 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40 
 
 
201 aa  117  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  37.3 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  38.33 
 
 
187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  39.67 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.76 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.9 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.16 
 
 
221 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.7 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.62 
 
 
221 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  32.46 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.62 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.97 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.11 
 
 
200 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.76 
 
 
217 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.76 
 
 
217 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.76 
 
 
217 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2319  nicotinamide mononucleotide transporter  30.5 
 
 
226 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.76 
 
 
217 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  32.21 
 
 
208 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.84 
 
 
189 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.84 
 
 
208 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.68 
 
 
188 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.52 
 
 
220 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.59 
 
 
192 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.03 
 
 
233 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  32.54 
 
 
215 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  36.19 
 
 
219 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  30.65 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  30.65 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.43 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.74 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.37 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.53 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.12 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.24 
 
 
241 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  32.54 
 
 
189 aa  95.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.39 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  27.53 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.24 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  26.24 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.24 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  28.64 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.3 
 
 
244 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  27.23 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.3 
 
 
244 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  28.64 
 
 
216 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.12 
 
 
212 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.3 
 
 
244 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0673  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.22 
 
 
234 aa  88.2  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000252701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  28.14 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  28.14 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  28.14 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  29.52 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  28.14 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00704  predicted nicotinamide mononucleotide transporter  24.43 
 
 
239 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00368961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.43 
 
 
239 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.16 
 
 
211 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00693  hypothetical protein  24.43 
 
 
239 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.47 
 
 
239 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.63 
 
 
241 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.43 
 
 
234 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.43 
 
 
239 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  27.64 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0779  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.43 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0775  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.43 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000228392  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0854  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.43 
 
 
239 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.83 
 
 
236 aa  85.5  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  29.23 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  24.77 
 
 
243 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.34 
 
 
213 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  24.77 
 
 
243 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0852  NMN family, nucleoside/purine/pyrimidine transporter  25 
 
 
239 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0884  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200323  normal  0.769102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.44 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  27.66 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0821  PnuC protein  25.47 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0916  protein PnuC  25 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.74639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>