121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2713 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  100 
 
 
221 aa  435  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  92.31 
 
 
221 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  92.31 
 
 
221 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  92.31 
 
 
221 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  90.87 
 
 
217 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  90.87 
 
 
217 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  90.38 
 
 
217 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  90.38 
 
 
217 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  83.74 
 
 
233 aa  315  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  70.67 
 
 
220 aa  315  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  72.33 
 
 
215 aa  299  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  63.68 
 
 
213 aa  276  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  69.08 
 
 
215 aa  275  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2319  nicotinamide mononucleotide transporter  62.56 
 
 
226 aa  272  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  66.99 
 
 
212 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  57.63 
 
 
236 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  52.78 
 
 
200 aa  197  7.999999999999999e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  48.84 
 
 
217 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  45.27 
 
 
208 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  45.7 
 
 
197 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02803  transporter, putative  43.23 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.860055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  45.3 
 
 
215 aa  154  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  33.69 
 
 
187 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  34.76 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.46 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.89 
 
 
189 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  32.61 
 
 
191 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  32.09 
 
 
187 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.16 
 
 
212 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  34.24 
 
 
191 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  32.07 
 
 
188 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  32.79 
 
 
187 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.9 
 
 
197 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.98 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.98 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.24 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  28.95 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  30.99 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  30.99 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.5 
 
 
223 aa  89  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  29.59 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.86 
 
 
220 aa  85.5  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  30.23 
 
 
189 aa  85.5  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.63 
 
 
228 aa  85.1  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.49 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.82 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.55 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  29.53 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.53 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.53 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.78 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.69 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  28.04 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.22 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.33 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.59 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  26.15 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.35 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.84 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.46 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.27 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.47 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.81 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.33 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  22.87 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2834  Nicotinamide mononucleotide transporter-like protein  24.86 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.63 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  21.63 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.63 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  30.56 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.11 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.58 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.33 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.11 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.11 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.19 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  21.55 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  21.68 
 
 
243 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  22.27 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  22.71 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.29 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  21.86 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  22.01 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  22.01 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  22.01 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  22.01 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.78 
 
 
241 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  21.94 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01590  nicotinamide mononucleotide transporter  24.06 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.702697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.08 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  21.53 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1668  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000335  ribosyl nicotinamide transporter PnuC-like protein  22.71 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.258606  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0225  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.04 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1079  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.6 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.83 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22 
 
 
241 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1330  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.94 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3134  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.06 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.65 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
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