125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5421 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



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Plasmid clonability

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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  100 
 
 
203 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  99.01 
 
 
203 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  96.34 
 
 
203 aa  361  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  93.65 
 
 
210 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  91.79 
 
 
214 aa  347  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  91.79 
 
 
214 aa  347  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  91.79 
 
 
214 aa  347  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  48.94 
 
 
187 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  49.47 
 
 
187 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  49.22 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  51.05 
 
 
191 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  47.37 
 
 
188 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.21 
 
 
188 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  45.26 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  46.8 
 
 
191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  50.26 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  46.32 
 
 
189 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.71 
 
 
204 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  49.47 
 
 
191 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  49.49 
 
 
192 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  42.19 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36 
 
 
209 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.86 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.66 
 
 
222 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.2 
 
 
188 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  35.94 
 
 
189 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.98 
 
 
214 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  32.47 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.85 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.78 
 
 
220 aa  99  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.34 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  36.6 
 
 
219 aa  95.1  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.11 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.11 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.11 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.89 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.45 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  28.23 
 
 
244 aa  89  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.34 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.89 
 
 
200 aa  89  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.62 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.14 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.43 
 
 
209 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.96 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  25.25 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  25.25 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  24.34 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.62 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.44 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  28.37 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.37 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.36 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.87 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.36 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.19 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.84 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  27.19 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.19 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000335  ribosyl nicotinamide transporter PnuC-like protein  29.67 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.258606  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2319  nicotinamide mononucleotide transporter  23.38 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.79 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  27.84 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.67 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.27 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  25.51 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.85 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  24.23 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2777  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.87 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  24.12 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.6 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  25.36 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  25.36 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  23.62 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  23.62 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.34 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.12 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  23.62 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  23.62 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1079  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.43 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.1 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  23.62 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  28.72 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.23 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.56 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0884  hypothetical protein  27.15 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200323  normal  0.769102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0852  NMN family, nucleoside/purine/pyrimidine transporter  27.15 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0821  PnuC protein  27.15 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  19.9 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  25.93 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0916  protein PnuC  26.7 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.74639 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0793  protein PnuC  27.15 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000546447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.92 
 
 
241 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  21.21 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_2595  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.26 
 
 
61 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0775  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.4 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000228392  normal 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.67 
 
 
241 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
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