72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0338 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0338  nicotinamide mononucleotide transporter  100 
 
 
219 aa  426  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.496829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2777  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.77 
 
 
234 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1096  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.85 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000531611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3134  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.78 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  19.81 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0387  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.55 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0605919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.2 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.84 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.94 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.83 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.77 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.44 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  25.97 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  25.97 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  25.97 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  25.97 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  25.97 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.33 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  25.97 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.39 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.7 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  26.81 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  22.91 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.91 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.91 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  24.26 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.49 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.03 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.23 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  30.66 
 
 
187 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  27.34 
 
 
191 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.82 
 
 
188 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.53 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.35 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  24.04 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  25.18 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0901  nicotinamide mononucleotide transporter  23.87 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.19 
 
 
222 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.9 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1518  nicotinamide mononucleotide transporter  20.2 
 
 
255 aa  48.9  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0821  PnuC protein  28.7 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0916  protein PnuC  28.7 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.74639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0793  protein PnuC  28.7 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000546447  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0884  hypothetical protein  28.7 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200323  normal  0.769102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0852  NMN family, nucleoside/purine/pyrimidine transporter  28.7 
 
 
239 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00693  hypothetical protein  20.24 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.07 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.24 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0854  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.24 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00704  predicted nicotinamide mononucleotide transporter  20.24 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00368961  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  21.43 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0673  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.24 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000252701  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  29.21 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.24 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0779  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.8 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.24 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  28.04 
 
 
243 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28 
 
 
244 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0775  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  19.64 
 
 
239 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000228392  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28 
 
 
244 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.81 
 
 
217 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  27.1 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  25.93 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.86 
 
 
189 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  23.39 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.58 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.21 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  28.38 
 
 
252 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.08 
 
 
220 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.92 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.85 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>