126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2172 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  100 
 
 
189 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  71.35 
 
 
191 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  74.05 
 
 
191 aa  255  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  65.95 
 
 
187 aa  251  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  65.95 
 
 
188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  65.41 
 
 
188 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  64.86 
 
 
188 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  59.46 
 
 
187 aa  229  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  59.89 
 
 
187 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  62.7 
 
 
192 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  50.52 
 
 
191 aa  175  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  46.84 
 
 
203 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  46.32 
 
 
203 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  46.84 
 
 
203 aa  157  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  46.28 
 
 
210 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  45.88 
 
 
214 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  45.88 
 
 
214 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  45.88 
 
 
214 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.79 
 
 
197 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.64 
 
 
204 aa  131  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.62 
 
 
189 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  38.71 
 
 
209 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40.66 
 
 
208 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  38.38 
 
 
222 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.83 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.71 
 
 
220 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  37.63 
 
 
189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.26 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.74 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  37.91 
 
 
214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.24 
 
 
212 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.33 
 
 
200 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.21 
 
 
221 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  39.67 
 
 
220 aa  110  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  33.89 
 
 
221 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.84 
 
 
224 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.58 
 
 
215 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  28.65 
 
 
202 aa  105  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  33.33 
 
 
215 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2319  nicotinamide mononucleotide transporter  31.98 
 
 
226 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.54 
 
 
217 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.54 
 
 
217 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.54 
 
 
217 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.54 
 
 
217 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.58 
 
 
233 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.67 
 
 
228 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.11 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.35 
 
 
236 aa  98.2  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.02 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.22 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.61 
 
 
201 aa  97.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.39 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  40.11 
 
 
219 aa  95.5  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  33.52 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.93 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  32.78 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  32.78 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.11 
 
 
207 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.18 
 
 
217 aa  92  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.13 
 
 
244 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.13 
 
 
244 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.13 
 
 
244 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.36 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.71 
 
 
241 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.5 
 
 
241 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  28.23 
 
 
244 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.78 
 
 
241 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  27.78 
 
 
241 aa  88.2  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.67 
 
 
216 aa  88.2  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.78 
 
 
241 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.89 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  28.02 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  28.02 
 
 
216 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  28.02 
 
 
216 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  28.02 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  28.02 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  27.53 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30 
 
 
241 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  29.73 
 
 
216 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.13 
 
 
223 aa  85.5  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.78 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  28.02 
 
 
216 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0387  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.18 
 
 
225 aa  84.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0605919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1079  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.91 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.17 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2834  Nicotinamide mononucleotide transporter-like protein  30.41 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2595  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  55.74 
 
 
61 aa  79.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0852  NMN family, nucleoside/purine/pyrimidine transporter  26.64 
 
 
239 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  25.68 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0884  hypothetical protein  26.64 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200323  normal  0.769102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.5 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00704  predicted nicotinamide mononucleotide transporter  26.64 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00368961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.64 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.64 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00693  hypothetical protein  26.64 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.64 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0821  PnuC protein  26.64 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0916  protein PnuC  26.17 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.74639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>