95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02803 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02803  transporter, putative  100 
 
 
214 aa  431  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.860055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  47.42 
 
 
215 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.51 
 
 
220 aa  158  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  43.23 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  43.15 
 
 
213 aa  154  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  46.29 
 
 
221 aa  154  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  46.29 
 
 
221 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  45.71 
 
 
221 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2319  nicotinamide mononucleotide transporter  40.09 
 
 
226 aa  148  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  44.26 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  38.86 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.55 
 
 
212 aa  138  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  39.42 
 
 
217 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.52 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40.88 
 
 
233 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.86 
 
 
217 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.86 
 
 
217 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.86 
 
 
217 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.86 
 
 
217 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  32.37 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  38.71 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.81 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.15 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.24 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  29.26 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.57 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.64 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.8 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  31.87 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  29.21 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.8 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  28.57 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  28.57 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.56 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.6 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  25.84 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.37 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  28.87 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.7 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.32 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  28.87 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  28.87 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  28.87 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  29.53 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  28.87 
 
 
216 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  28.87 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.63 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  27.78 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  26.4 
 
 
191 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.15 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  27.78 
 
 
187 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  23.56 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.56 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.56 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  23.68 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.01 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  25.14 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.27 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.29 
 
 
199 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.93 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2834  Nicotinamide mononucleotide transporter-like protein  23.35 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.63 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.07 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.16 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.63 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  25.7 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  42.03 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.87 
 
 
224 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01590  nicotinamide mononucleotide transporter  25.36 
 
 
244 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.702697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  22.16 
 
 
189 aa  51.6  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0225  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.49 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  26.2 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.63 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.81 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.67 
 
 
189 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.81 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3134  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.21 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.81 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  24.6 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.66 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0387  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.32 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0605919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  24.31 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0779  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.73 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16090  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.16 
 
 
235 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1668  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.36 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  26.75 
 
 
245 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.67 
 
 
232 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00693  hypothetical protein  22.73 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.73 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.73 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00704  predicted nicotinamide mononucleotide transporter  22.73 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00368961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.73 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1373  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.32 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341199  normal  0.244006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>