22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2083 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1198    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  35.12 
 
 		 501 aa  240  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  32.09 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  29.04 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  29.02 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  28.66 
 
 		 438 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  28.43 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  28.71 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  28.38 
 
 		 446 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  27.5 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  26.57 
 
 		 627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  26.63 
 
 		 627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5739  hypothetical protein  22.84 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  24.12 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  25.41 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  25.66 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  23.89 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  25.4 
 
 		 484 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  26.71 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3713  hypothetical protein  29.69 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000844508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  31.08 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>