18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0837 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  1018    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  61.81 
 
 
492 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  61.4 
 
 
492 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  36.04 
 
 
484 aa  239  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  25.05 
 
 
571 aa  90.1  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  27.31 
 
 
484 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  25.4 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  23.3 
 
 
580 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  28.93 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  28.93 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  28.93 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  28.43 
 
 
438 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  29.03 
 
 
671 aa  57.4  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  27.23 
 
 
446 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  25.5 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  26.81 
 
 
502 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  25.1 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  30.49 
 
 
501 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>