18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0322 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  1008    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  39.78 
 
 		 492 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  39.14 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  36.04 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  27.64 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  27.38 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  25.78 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  25 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  26.09 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  22.43 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  26.09 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  26.09 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  26.09 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  26.42 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  26.53 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  25.4 
 
 		 580 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  24.9 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  24.24 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>