22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1994 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  99.54 
 
 
438 aa  906    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  99.09 
 
 
438 aa  903    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  910    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  99.32 
 
 
438 aa  903    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  50.12 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  48.96 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  49.88 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  32.69 
 
 
671 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  30.09 
 
 
627 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  30.09 
 
 
627 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  28.91 
 
 
580 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  31.33 
 
 
501 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5739  hypothetical protein  28.43 
 
 
562 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  26.13 
 
 
502 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  26.09 
 
 
484 aa  60.1  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  28.93 
 
 
488 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  28.69 
 
 
492 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  29.11 
 
 
492 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3713  hypothetical protein  24.87 
 
 
413 aa  56.6  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000844508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  24.44 
 
 
571 aa  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  32.47 
 
 
484 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  33.72 
 
 
490 aa  46.6  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>