17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0434 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  1012    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  37.77 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  28.6 
 
 
571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  25.4 
 
 
488 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  25.72 
 
 
492 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  28.85 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  24.7 
 
 
501 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  22.43 
 
 
484 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  33.03 
 
 
671 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  22.98 
 
 
502 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  31.08 
 
 
580 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  25.69 
 
 
627 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  25.69 
 
 
627 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  33.72 
 
 
438 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  33.72 
 
 
438 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  33.72 
 
 
438 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  33.72 
 
 
438 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>