16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0282 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  100 
 
 
627 aa  1289    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  99.36 
 
 
627 aa  1279    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  29.65 
 
 
438 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  30.3 
 
 
438 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  30.3 
 
 
438 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  30.09 
 
 
438 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5739  hypothetical protein  29.43 
 
 
562 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  27.19 
 
 
446 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  26.64 
 
 
671 aa  141  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  27.19 
 
 
446 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  27.29 
 
 
446 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  26.57 
 
 
580 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  25.71 
 
 
502 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  24.74 
 
 
501 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  23.05 
 
 
571 aa  51.2  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  25.69 
 
 
490 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>