20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4641 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1030    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  33.27 
 
 		 580 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  30.77 
 
 		 671 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  29.49 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  29.42 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  28.57 
 
 		 446 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  28.25 
 
 		 501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  26.86 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  26.86 
 
 		 438 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  26.86 
 
 		 438 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  26.8 
 
 		 438 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  25.71 
 
 		 627 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  26.12 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5739  hypothetical protein  25.29 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  23.46 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  23.08 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  23.08 
 
 		 490 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  26.81 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  24.06 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  27.86 
 
 		 484 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>