20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2290 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  999    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  37.77 
 
 
490 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  26.91 
 
 
492 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  26.51 
 
 
492 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  25.59 
 
 
571 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  27.36 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  25.61 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  23.97 
 
 
501 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  27.54 
 
 
580 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  28.21 
 
 
502 aa  53.5  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  32.47 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  32.47 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  32.47 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  32.47 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  23.55 
 
 
446 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  24.38 
 
 
446 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  23.14 
 
 
446 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  25.23 
 
 
671 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  25.21 
 
 
627 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  25.21 
 
 
627 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>