20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4059 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  98.88 
 
 		 446 aa  909    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  93.95 
 
 		 446 aa  875    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  920    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  49.65 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  49.88 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  49.88 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  49.42 
 
 		 438 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  32.52 
 
 		 671 aa  176  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  28.29 
 
 		 580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  29.21 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  27.19 
 
 		 627 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  27.92 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5739  hypothetical protein  27.2 
 
 		 562 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 501 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3713  hypothetical protein  27.75 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000844508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  26.42 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  25.5 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  23.79 
 
 		 492 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  24.87 
 
 		 492 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  25.94 
 
 		 571 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>