17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5739 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5739  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1160    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  29.49 
 
 
627 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  29.55 
 
 
627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  28.63 
 
 
438 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  27.94 
 
 
438 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  28.43 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  27.75 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  27.2 
 
 
446 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  27.16 
 
 
446 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  27 
 
 
446 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  24.32 
 
 
501 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  24.1 
 
 
671 aa  99.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  25.05 
 
 
502 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  23.45 
 
 
580 aa  84  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  25.63 
 
 
571 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  35.29 
 
 
492 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  35.29 
 
 
492 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>