More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2248 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 421 aa  819    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  65.38 
 
 		 412 aa  537  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  65.86 
 
 		 411 aa  531  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  62.59 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  61.54 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  60.15 
 
 		 414 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  59.76 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  60.1 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  60.05 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  62.62 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  61.9 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  58.45 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  57.73 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  57.49 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1836  uracil-xanthine permease  60.84 
 
 		 411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0253304  normal  0.750298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  56.97 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  58.6 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  58.6 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0997  uracil-xanthine permease  58.72 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  58.48 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  54.35 
 
 		 425 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  58.1 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  60.9 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  57.36 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2443  uracil-xanthine permease  61.22 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.161391  normal  0.0740726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1965  uracil-xanthine permease  59.65 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1641  uracil-xanthine permease  60.5 
 
 		 407 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000923826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  57.61 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  57.36 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  57.91 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000161239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  57.91 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000126712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  57.91 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000163317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  58.37 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  57.42 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  57.66 
 
 		 412 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1641  uracil-xanthine permease  57.66 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000740931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  57.42 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000647194  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  58 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  56.01 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  59.55 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  55.28 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1689  uracil-xanthine permease  58.65 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000578916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  55.1 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  56.27 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  54.85 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  56.28 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  54 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  56.66 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  51.21 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  49.38 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  48.59 
 
 		 409 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  44.86 
 
 		 403 aa  331  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  45.61 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  43.75 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  44.12 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  42.62 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  42.93 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  42.68 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  42.68 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  42.68 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  42.68 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  42.68 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  42.68 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  42.68 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  42.68 
 
 		 427 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  43.69 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  43.69 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  43.86 
 
 		 399 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  43.86 
 
 		 399 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  41.87 
 
 		 430 aa  298  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  41.87 
 
 		 430 aa  296  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  40.63 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  40.14 
 
 		 436 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  40 
 
 		 403 aa  282  9e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  41 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  40.14 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  39.2 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  41.71 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  43.03 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  40.99 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  38.52 
 
 		 422 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  44.28 
 
 		 434 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  41.81 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  41.81 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  41.81 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  40 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  37.5 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  37.79 
 
 		 469 aa  256  6e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  37.24 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  37.5 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  37.5 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  37.5 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  37.5 
 
 		 429 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  36.27 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  36.27 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  37.5 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  38.08 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  37.24 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  37.34 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  37.34 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>