More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0593 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  80.83 
 
 
411 aa  664    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  100 
 
 
412 aa  805    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  73.59 
 
 
417 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  65.38 
 
 
421 aa  526  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  57.97 
 
 
414 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  61.25 
 
 
417 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  61 
 
 
417 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  60.75 
 
 
417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  60.05 
 
 
411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  59.05 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  56.55 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  56.72 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  56.23 
 
 
419 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  60.15 
 
 
416 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  62.92 
 
 
409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  55.07 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  57 
 
 
412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1836  uracil-xanthine permease  60.05 
 
 
411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0253304  normal  0.750298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  59.75 
 
 
415 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1641  uracil-xanthine permease  60.51 
 
 
407 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000923826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1641  uracil-xanthine permease  60.55 
 
 
412 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000740931  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  58.4 
 
 
413 aa  441  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  60.05 
 
 
412 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  60.05 
 
 
412 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  55.42 
 
 
427 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  57.43 
 
 
418 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  55.17 
 
 
427 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  60.05 
 
 
412 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2443  uracil-xanthine permease  59.09 
 
 
408 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.161391  normal  0.0740726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  59.25 
 
 
416 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000161239  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  59 
 
 
416 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000163317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1965  uracil-xanthine permease  60.41 
 
 
418 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  59 
 
 
416 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000647194  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  59 
 
 
416 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000126712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  53.62 
 
 
416 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  54.95 
 
 
425 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1689  uracil-xanthine permease  59.6 
 
 
412 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000578916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  52.76 
 
 
424 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  53 
 
 
421 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0997  uracil-xanthine permease  56.16 
 
 
419 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  52.52 
 
 
421 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  55 
 
 
406 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  54.95 
 
 
424 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  54.25 
 
 
415 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  52.52 
 
 
421 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  54.42 
 
 
420 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  54.25 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  54 
 
 
425 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  51.63 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  50.75 
 
 
395 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  48.7 
 
 
409 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  43.78 
 
 
427 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  43.53 
 
 
438 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  44.33 
 
 
403 aa  330  4e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  43.53 
 
 
438 aa  329  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  43.64 
 
 
430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  43.53 
 
 
438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  43.53 
 
 
427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  43.53 
 
 
427 aa  329  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  43.53 
 
 
427 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  44.28 
 
 
427 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  43.53 
 
 
427 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  45.71 
 
 
415 aa  329  7e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  43.28 
 
 
427 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  46.53 
 
 
433 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  44.12 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  44.12 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  42.51 
 
 
435 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  42.51 
 
 
435 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  41.98 
 
 
430 aa  310  4e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  43.81 
 
 
430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  41.5 
 
 
423 aa  298  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  41.79 
 
 
403 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  41.71 
 
 
469 aa  286  5e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  40.88 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  44.19 
 
 
434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  39.65 
 
 
423 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  41.48 
 
 
436 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  41.54 
 
 
423 aa  280  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  41.23 
 
 
436 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  41.08 
 
 
430 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  38.96 
 
 
429 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  43.18 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  41.09 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  36.87 
 
 
432 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  36.62 
 
 
432 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  39.75 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  37.53 
 
 
429 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  37.53 
 
 
429 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  38.24 
 
 
429 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  41.46 
 
 
443 aa  264  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  37.44 
 
 
422 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  37.53 
 
 
429 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  37.53 
 
 
429 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  37.53 
 
 
429 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  37.53 
 
 
429 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  37.53 
 
 
429 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  37.53 
 
 
429 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  37.53 
 
 
429 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  37.53 
 
 
429 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>