More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2443 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2443  uracil-xanthine permease  100 
 
 
408 aa  791    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.161391  normal  0.0740726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  85.19 
 
 
416 aa  663    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000163317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  84.94 
 
 
416 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000161239  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  85.43 
 
 
412 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1965  uracil-xanthine permease  87.5 
 
 
418 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  92.59 
 
 
415 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1689  uracil-xanthine permease  84.9 
 
 
412 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000578916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1836  uracil-xanthine permease  89 
 
 
411 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0253304  normal  0.750298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  85.68 
 
 
416 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000647194  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  85.68 
 
 
412 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  85.43 
 
 
412 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  83.91 
 
 
409 aa  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  85.19 
 
 
416 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000126712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1641  uracil-xanthine permease  85.43 
 
 
412 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000740931  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1641  uracil-xanthine permease  81.82 
 
 
407 aa  633  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000923826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  82.21 
 
 
409 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  75.5 
 
 
417 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  73.83 
 
 
417 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  73.12 
 
 
427 aa  586  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  74 
 
 
417 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  72.77 
 
 
416 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  73 
 
 
411 aa  574  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  64.16 
 
 
414 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  64.99 
 
 
421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  64.99 
 
 
421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  65.24 
 
 
421 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  65.24 
 
 
424 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  64.74 
 
 
425 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  65.49 
 
 
424 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  64.99 
 
 
427 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  65.24 
 
 
427 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  65.83 
 
 
418 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  64.74 
 
 
411 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  63.93 
 
 
441 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  64.8 
 
 
406 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  62.75 
 
 
425 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  67.43 
 
 
420 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  62.75 
 
 
425 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  62.25 
 
 
416 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  60.81 
 
 
419 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  60.56 
 
 
412 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  61.15 
 
 
425 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  62.03 
 
 
417 aa  477  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  59.75 
 
 
415 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  63.03 
 
 
413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  61.22 
 
 
421 aa  463  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  59.09 
 
 
412 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  57.32 
 
 
411 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0997  uracil-xanthine permease  59.05 
 
 
419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  49.87 
 
 
395 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  50.39 
 
 
409 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  47.54 
 
 
415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  48.14 
 
 
403 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  46.78 
 
 
427 aa  339  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  47.16 
 
 
430 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  48.17 
 
 
433 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  45.5 
 
 
427 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  45.25 
 
 
427 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  45.25 
 
 
430 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  45.25 
 
 
438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  45.25 
 
 
438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  45.25 
 
 
427 aa  329  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  45.25 
 
 
427 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  45.25 
 
 
427 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  45.25 
 
 
438 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  45.25 
 
 
427 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  44.33 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  44.33 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  45.19 
 
 
430 aa  310  4e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  44.84 
 
 
399 aa  306  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  44.84 
 
 
399 aa  306  6e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  43.22 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  43.88 
 
 
432 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  44.12 
 
 
432 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  44.12 
 
 
432 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  46.02 
 
 
432 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  44.23 
 
 
436 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  44.25 
 
 
436 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  45.5 
 
 
434 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  41.75 
 
 
423 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  44.12 
 
 
434 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  39.44 
 
 
423 aa  287  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  38.69 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  42.93 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  38.69 
 
 
429 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  41.11 
 
 
457 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  38.94 
 
 
429 aa  279  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  37.8 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1891  uracil-xanthine permease  42.78 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  38.7 
 
 
469 aa  272  7e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  37.65 
 
 
429 aa  272  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  38.4 
 
 
428 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  38.4 
 
 
428 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  37.65 
 
 
429 aa  272  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  37.65 
 
 
429 aa  272  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  37.65 
 
 
429 aa  272  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  37.65 
 
 
429 aa  272  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  37.65 
 
 
429 aa  272  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  37.65 
 
 
429 aa  272  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  37.65 
 
 
429 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>