141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2716 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2660  arginine repressor  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2716  arginine repressor  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2251  ArgR family transcriptional regulator  54.73 
 
 
153 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  28.19 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  29.8 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  29.8 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  29.14 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  29.14 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  27.81 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  31.79 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  31.13 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  31.13 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  31.13 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  31.13 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  32.14 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  27.89 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  25 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  31.65 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1600  ArgR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  26.14 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  25 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  25.5 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  26.39 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  26.39 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  25.35 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  29.55 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  18.71 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  22.45 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  31.33 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  23.4 
 
 
188 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  22.76 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  25 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  25 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  26.73 
 
 
189 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  23.75 
 
 
177 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  27.92 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  25.74 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  25.74 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  25.74 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  25.74 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  25.74 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  23.75 
 
 
187 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  26.32 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  26.32 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  30.22 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  28.15 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  25.74 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  25.74 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  22.14 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  23.27 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  26.85 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  26.14 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  21.79 
 
 
186 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  25 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0161  arginine repressor  29.25 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  21.28 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  26.24 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  23.75 
 
 
167 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  24.11 
 
 
195 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  23.94 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  26.85 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0165  arginine repressor  28.57 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  19.35 
 
 
184 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  23.13 
 
 
177 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  21.53 
 
 
234 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  22.79 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  25.87 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  21.83 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  24.11 
 
 
145 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  19.08 
 
 
146 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0446  ArgR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  25 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  23.6 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0500  arginine repressor ArgR, putative  27.4 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.080727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  31.54 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  22.45 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  24.03 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  18.71 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  26.09 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  23.23 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  20.25 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  19.42 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  20.25 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  27.4 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1179  ArgR family transcriptional regulator  18.83 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000244542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  19.42 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  23.49 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  24.48 
 
 
144 aa  47  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  21.05 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  19.31 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  22.67 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  27.21 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  24.48 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0991989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>