120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1179 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1179  ArgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  312  9e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000244542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  42.95 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  40.27 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  39.86 
 
 		 150 aa  110  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  39.86 
 
 		 150 aa  110  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  40.54 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  41.1 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1600  ArgR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  39.6 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  38.93 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  38.93 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  37.24 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  37.31 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  35.14 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  35.37 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  35.14 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  34.46 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0500  arginine repressor ArgR, putative  32.47 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.080727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  34 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  36.5 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  32.67 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  33.56 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  30.87 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  31.29 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  30.87 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  30.2 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1180  transcriptional repressor protein, putative  33.33 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000314701  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  30.2 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  30.2 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  29.53 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  29.53 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  31.61 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0929  ArgR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  30.87 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  28.1 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  28.1 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  29.14 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  29.14 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  29.14 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  29.22 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  29.11 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  29.86 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  29.73 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  29.05 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  28.48 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  33.33 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0165  arginine repressor  25 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0161  arginine repressor  25 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  29.66 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  29.86 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  30.26 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  26.62 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  26.28 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  28.48 
 
 		 172 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  28.66 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  27.92 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  28 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  28 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  29.05 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  28.97 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  26.42 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  30.77 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  33.97 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  30.6 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  31.75 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1214  ArgR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  28.48 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  27.56 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  27.97 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  28.15 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  28.39 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  28.48 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  29.71 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  29.85 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  27.78 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  28.57 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  29.03 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  31.85 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  30.6 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  29.32 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  29.32 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  29.85 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  29.87 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  27.59 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>