136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2251 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2251  ArgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2660  arginine repressor  54.73 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2716  arginine repressor  54.73 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  28.38 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  28.38 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  32.61 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  31.29 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  31.88 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  30.61 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  30.61 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  27.03 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  31.88 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  28.57 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  28.57 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  31.39 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  27.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  26.45 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  30.15 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  26.21 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  26.45 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  20.65 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  27.4 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  25.66 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  23.45 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  23.87 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  26.03 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1600  ArgR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  23.66 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  26.95 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  22.15 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  23.75 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  26.95 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  26.14 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  29.75 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  21.02 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  23.13 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  23.29 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  23.94 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  24.05 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  18.99 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  21.66 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1214  ArgR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  28.28 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  20.65 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  24.14 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  22.92 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  25.35 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  21.12 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  26.87 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  26.87 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  25.33 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  24.84 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  20.75 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  23.38 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  24.29 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  26.21 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  25.19 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  25.9 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1028  arginine repressor, ArgR  31.88 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  25 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  25 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  19.86 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0161  arginine repressor  22.45 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  27.7 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  25.5 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  24.79 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0165  arginine repressor  21.77 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  18.87 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  22.86 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  20.44 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  22.6 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  21.74 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  26.35 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  23.78 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  21.74 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  21.74 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  20 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  28.04 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  25 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  22.07 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  20.27 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0500  arginine repressor ArgR, putative  23.81 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.080727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  19.88 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>