20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0532 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  24.76 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  27.3 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  21.82 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  24.75 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  25.77 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  23.41 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  25.61 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  22.88 
 
 		 389 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  22.68 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  22.67 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  22.41 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  24.48 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  26.81 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  21.2 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  23.78 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  22.75 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  22.04 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  21.58 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  23.04 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>