21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1968 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  48.17 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  29 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  31.18 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  28.7 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  29.74 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  31.47 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  38.12 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  37.57 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  28.24 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  29.61 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  28.09 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  28.06 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  37.11 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  26.35 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  26.03 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  29.83 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  28.34 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  25.95 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  27.88 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  25.39 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>