21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1039 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  100 
 
 		 337 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  66.17 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  53.25 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  37.82 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  38.52 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  38.85 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  38.78 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  36.1 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  37.77 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  31.85 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  32.05 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  32.12 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  30.97 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  33.44 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  31.7 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  30.21 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  27.92 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  29.06 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  26.4 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  21.62 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>