21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5542 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  100 
 
 		 340 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  52.51 
 
 		 337 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  49.11 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  37.55 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  34.73 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  33.94 
 
 		 349 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  34.41 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  30.35 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  34.12 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  33.84 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  34.83 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  30.7 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  28.53 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  29.47 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  30.38 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  30.9 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  28.66 
 
 		 329 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  28.41 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  24.32 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  25.9 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  23.47 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>