22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1834 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  100 
 
 		 349 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  68.42 
 
 		 336 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  68.67 
 
 		 336 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  49.1 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  47.37 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  49.83 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  49.83 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  39.88 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  34.8 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  32.25 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  32.78 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  34.15 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  35.21 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  33.94 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  31.49 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  29.72 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  29.47 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  25.97 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  24.83 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  27.17 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  21.43 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2667  hypothetical protein  34.09 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>