22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2971 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  100 
 
 		 336 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  92.26 
 
 		 336 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  66.07 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  49.09 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  47.25 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  49.83 
 
 		 328 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  49.49 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  44.11 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  37.77 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  36.26 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  32.78 
 
 		 357 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  30.23 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  33.57 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  33.45 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  36.05 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  29.37 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  30.93 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  26.95 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  26.13 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  27.17 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2667  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>