21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2077 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  90.58 
 
 		 329 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  40.89 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  36.93 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  33.44 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  34.38 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  37.8 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  33.44 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  34.69 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  34.69 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  33.8 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  34.34 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  33.57 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  33.57 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  33.07 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  31.03 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  29.69 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  32.05 
 
 		 340 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  31.36 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  20.83 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  29.61 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>