21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1644 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  37.24 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  36.93 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  34.87 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  32.57 
 
 		 339 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  29.93 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  29.77 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  29.47 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  29.18 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  29.05 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  30.21 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  29.05 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  25.94 
 
 		 379 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  27.76 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  27.99 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  27.86 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  31.3 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  22.58 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  23.95 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  25.9 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  21.51 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>