21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2272 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  89.36 
 
 		 328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  88.75 
 
 		 328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  69 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  47.63 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  47 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  47.37 
 
 		 349 aa  268  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  48.05 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  40.52 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  39.34 
 
 		 333 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  34.57 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  34.26 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  34.46 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  29.72 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  32.07 
 
 		 357 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  29.85 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  29.81 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  30.2 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  31.58 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  29.44 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  23.47 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>