21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2435 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  691    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  33.56 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  29.62 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  33.58 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  27.45 
 
 
329 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  32.32 
 
 
328 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  27.38 
 
 
331 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  24.84 
 
 
340 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  29.2 
 
 
336 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  26.15 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  27.92 
 
 
337 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  28.41 
 
 
336 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  29.47 
 
 
349 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  27.46 
 
 
379 aa  89.7  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  31.21 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  28.93 
 
 
329 aa  86.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  31.21 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  27.84 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  23.91 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  27.27 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  23.48 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>