21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0769 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  100 
 
 		 333 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  66.17 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  49.69 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  38.27 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  38.49 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  38.97 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  39.27 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  37.86 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  34.34 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  34.9 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  33.89 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  33.44 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  31.83 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  33.05 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  33.56 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  28.09 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  29.35 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  28.21 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  23.36 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  29.57 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  26.77 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>