22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3202 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3202  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  666    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1968  hypothetical protein  48.17 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1900  hypothetical protein  29.7 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24530  hypothetical protein  30.63 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5542  putative transmembrane protein  28.06 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1039  putative transmembrane protein  28.52 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.714044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2272  hypothetical protein  30.92 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.752839  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4159  hypothetical protein  27.27 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135712  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2077  hypothetical protein  30.4 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0532  hypothetical protein  27.3 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000952803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2470  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0769  putative transmembrane protein  27.21 
 
 		 333 aa  99.4  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2077  hypothetical protein  29.69 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2435  hypothetical protein  29.84 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1495  putative transmembrane protein  27.45 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0020  hypothetical protein  27.15 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0363527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2971  putative transmembrane protein  26.95 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1834  putative transmembrane protein  24.83 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  hitchhiker  0.000685541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  27.44 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1733  hypothetical protein  24.34 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1644  hypothetical protein  26.18 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  27.27 
 
 		 959 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>