More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0222 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0222  magnesium chelatase ChlI subunit  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00277196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  54.34 
 
 
506 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  55.05 
 
 
513 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  52.53 
 
 
512 aa  246  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  53.46 
 
 
513 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  51.13 
 
 
506 aa  244  6.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  53.46 
 
 
512 aa  241  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
501 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  52.07 
 
 
511 aa  241  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  54.63 
 
 
510 aa  240  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  50.45 
 
 
501 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  53.24 
 
 
512 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  52.53 
 
 
512 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  52.07 
 
 
512 aa  238  5e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  52.07 
 
 
512 aa  237  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  47.75 
 
 
511 aa  237  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  51.85 
 
 
504 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  50.93 
 
 
507 aa  236  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0127  hypothetical protein  51.85 
 
 
226 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  54.84 
 
 
513 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3045  Mg chelatase-related protein  52.58 
 
 
233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165513  normal  0.962774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3674  magnesium chelatase ChlI subunit  51.64 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  50.9 
 
 
513 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  51.35 
 
 
509 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  53.21 
 
 
504 aa  233  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  52.31 
 
 
509 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  50.67 
 
 
510 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  50.93 
 
 
511 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  50 
 
 
506 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  52.78 
 
 
509 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  48.2 
 
 
509 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  49.31 
 
 
513 aa  231  7.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  49.54 
 
 
508 aa  230  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  52.51 
 
 
510 aa  229  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  51.17 
 
 
509 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  49.31 
 
 
514 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  49.54 
 
 
506 aa  228  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  48.15 
 
 
508 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  51.85 
 
 
508 aa  228  9e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  50.23 
 
 
511 aa  227  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  47.93 
 
 
509 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  46.85 
 
 
509 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  47.3 
 
 
509 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  47.3 
 
 
509 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  50.23 
 
 
509 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  50.46 
 
 
512 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  50 
 
 
496 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  49.54 
 
 
501 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  49.07 
 
 
512 aa  222  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  48.39 
 
 
511 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  45.95 
 
 
509 aa  221  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
530 aa  221  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  49.08 
 
 
507 aa  221  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  50.46 
 
 
523 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  47.22 
 
 
514 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  53.21 
 
 
516 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  47.25 
 
 
520 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  47 
 
 
554 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  48.62 
 
 
517 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  50.93 
 
 
513 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  49.54 
 
 
515 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  47.69 
 
 
512 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  48.15 
 
 
506 aa  217  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  48.82 
 
 
505 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  47.39 
 
 
505 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  49.07 
 
 
510 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  51.83 
 
 
516 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  46.76 
 
 
511 aa  215  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.95 
 
 
499 aa  215  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  47.51 
 
 
506 aa  214  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  50.93 
 
 
512 aa  214  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2773  competence protein ComM, putative  46.08 
 
 
291 aa  214  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  49.31 
 
 
516 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  47.25 
 
 
485 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  48.15 
 
 
529 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1349  Mg chelatase, subunit ChlI  45.95 
 
 
501 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  48.15 
 
 
517 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  48.62 
 
 
505 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  45.16 
 
 
505 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  50.46 
 
 
512 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  46.19 
 
 
516 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  49.32 
 
 
518 aa  211  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  47.69 
 
 
506 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  46.08 
 
 
512 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  47.69 
 
 
495 aa  208  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  47.69 
 
 
549 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  49.33 
 
 
503 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  45.83 
 
 
498 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  44.91 
 
 
509 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  48.61 
 
 
510 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  48.18 
 
 
501 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  48.43 
 
 
503 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  47.95 
 
 
518 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  47.03 
 
 
518 aa  204  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1175  Mg chelatase, subunit ChlI  46.76 
 
 
499 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  47.22 
 
 
504 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  46.4 
 
 
497 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  48.17 
 
 
510 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  43.72 
 
 
509 aa  202  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0106  Mg(2+) chelatase family protein  48.39 
 
 
284 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>