162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0908 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  222  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0855  ankyrin  91.43 
 
 		 112 aa  203  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3431  ankyrin  39.44 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  39.13 
 
 		 483 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  42.11 
 
 		 395 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  41.38 
 
 		 1061 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  35.62 
 
 		 382 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  40.68 
 
 		 1585 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  43.42 
 
 		 490 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  33.73 
 
 		 342 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  29.7 
 
 		 234 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  35.11 
 
 		 450 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0237  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0982  ankyrin  38.57 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.728447  normal  0.673104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  35.37 
 
 		 479 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  44.07 
 
 		 369 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  37.68 
 
 		 1156 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  42.37 
 
 		 1133 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  34.38 
 
 		 583 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  35 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0253  ankyrin repeat-containing domain protein  33.75 
 
 		 238 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.664865 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  36.63 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  29.81 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  29.81 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  39.06 
 
 		 584 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  36.49 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  29.81 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3905  Ankyrin  36.99 
 
 		 1112 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2863  Ankyrin  42.42 
 
 		 320 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  29.81 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  40.62 
 
 		 278 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  35.53 
 
 		 640 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1402 aa  47.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  36.23 
 
 		 404 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  34.78 
 
 		 574 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  37.18 
 
 		 494 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.31 
 
 		 428 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  35.59 
 
 		 249 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  34.41 
 
 		 296 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  31.37 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  27.88 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  36.62 
 
 		 269 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  34.25 
 
 		 581 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3435  ankyrin repeat-containing protein  38.89 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  41.38 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  31.43 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.1 
 
 		 762 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  34.25 
 
 		 345 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  29.03 
 
 		 445 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  41.38 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  35.62 
 
 		 1097 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  31.25 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  31.65 
 
 		 469 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0637  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  33.96 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  33.33 
 
 		 715 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  39.02 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2098  Ankyrin  32.22 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  39.34 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  36.23 
 
 		 870 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1878  hypothetical protein  33.8 
 
 		 806 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  34.29 
 
 		 236 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  34.09 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  36.71 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.88 
 
 		 731 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2080  Ankyrin  38.81 
 
 		 668 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000184702  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2171 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  35.44 
 
 		 222 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  36.36 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  30.86 
 
 		 821 aa  44.3  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  24.76 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  38.96 
 
 		 261 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36555  predicted protein  34.21 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  35.59 
 
 		 321 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  34.21 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  40.32 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  35.62 
 
 		 1101 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  37.29 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  35.62 
 
 		 1099 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  34.21 
 
 		 855 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2373  Ankyrin  36.62 
 
 		 555 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000336897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  26.92 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  32.05 
 
 		 274 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  38.18 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  35.29 
 
 		 544 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4381  ankyrin  39.66 
 
 		 589 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1640  hypothetical protein  38.89 
 
 		 297 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.951385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  34.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2411  Ankyrin  42.11 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.020704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  34.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43531  predicted protein  32.94 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181933  normal  0.18997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  37.7 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2916  hypothetical protein  32.39 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  24.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  37.29 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0830  hypothetical protein  40.91 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0248874 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  34.44 
 
 		 790 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  35.62 
 
 		 954 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  36.11 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>